В 2009 году свидетельство о результатах ЕГЭ фактически является экзаменационным листом вступительных экзаменов в вуз.

В свидетельство о ЕГЭ выставляются "положительные" результаты по обязательным для выпускников предметам (русскому языку и математике), а также баллы, полученные по так называемым предметам по выбору, по которым преодолен минимальный порог, установленный Рособрнадзором.

Сдавать предметы по выбору в форме ЕГЭ должны те, кто планирует получить высшее или среднее специальное образование. Сдать можно любое количество предметов из списка:
Литература
Физика
Химия
Биология
География
История
Обществознание
Иностранный язык (английский, немецкий, французский, испанский)
Информатика и информационно-коммуникационные технологии (информатика и ИКТ)

Выбор должен быть основан на Перечне вступительных испытаний в вузы.

Вступительные испытания

В 2009 году вуз вправе оставить 3 из 4 вступительных испытаний, рекомендованных по каждой специальности. Обязательными для поступления на все специальности являются ЕГЭ по русскому языку и так называемому профильному предмету (Перечень).

Вуз самостоятельно определяет минимальное количество "проходных" баллов только по профильному предмету специальности, который должен быть не меньше нижней пороговой границы Рособрнадзора. По всем предметам минимальный порог становится
известен в течение 6-8 во время сдачи ЕГЭ в основной период (с 26 мая по 19 июня) - см. раздел "Основные сведения о ЕГЭ".

Вузам запрещено проводить какие-либо другие испытания для абитуриентов.

к вопросу о проходном балле - так это для платников, а проходной на бюджет формируется вроде как только к первой волне зачисления